主要有随机扩散，这种方式主要以浓度差为推动力，有高浓度扩散向低浓度。协助扩散，也是由高浓度向低浓度扩散，不过还受制于载体的数量。

主动运输，通过蛋白质载体主动吸收一些营养物质分子，这些营养物质分子往往需要进行一些特殊的化学修饰才能进入细胞内，如葡萄糖的磷酸化。

以上的运输方式没有种属特异性，适用于几乎所有的微生物细胞，所以，不存在代表微生物这一说法，只有代表物质。如随机扩散的氧气，协助扩散的钾离子，海带主动运输的碘离子。

现代定义

肉眼难以看清，需要借助光学显微镜或电子显微镜才能观察到的一切微小生物的总称，微生物包括细菌、病毒、真菌和少数藻类等。（但有些微生物是肉眼可以看见的，像属于真菌的蘑菇、灵芝等）。

病毒是一类由核酸和蛋白质等少数几种成分组成的“非细胞生物”，但是它的生存必须依赖于活细胞。根据存在的不同环境分为空间微生物、海洋微生物等，按照细胞结构分类分为原核微生物和真核微生物。