蜂巢发黑其实原因很多，要根据不同的情况来判断。蜂蜜中含有的矿物质尤其是铁的含量比较高，花粉色泽比较深，蜂巢蜜的颜色就会比较深，而蜂巢蜜很多都是百花蜜，含有的花蜜种类比较多，所以有些颜色比较深，使得蜂巢蜜颜色发黑，这是很正常的现象，这样的蜂巢蜜是可以正常食用的，在都是优质蜂巢蜜的前提下，与其他蜂巢蜜相比质量没有优劣之分。

当然蜂巢发黑还有一种情况，就是老巢蜜，老巢蜜是一年以上，两年以下的巢蜜，富含花粉、蜂胶、蜂巢素等有效成分，成分比较复杂，而且已经取过几次蜜，繁殖过几批幼蜂，而蜜蜂繁殖过的蜂房，蜜蜂从虫蜕变成蜂会在蜂房中留下一层蜂衣，多次繁殖后蜂衣就逐渐变成黑色，所以老巢蜜的颜色就会发黑。

老巢蜜因为含蜂蜡含量比较多，色黑且较硬，嚼起来口感不好，并且其中的蜂巢素容易使人过敏，所以不建议大家食用，老巢蜜一般直接入药使用。因此，蜂巢蜜发黑需要大家具体情况具体分析，挑选蜂巢蜜的时候最好选择经过多方质量检测合格的优质巢蜜。