来到博士的研究所，博士给了主角一张从浅葱市前往枯叶市的船票。

进入浅葱市码头的大门，便见到大木博士早早的就在这里等待了。他将主角的图鉴升级为了全国图鉴。

接着上船，刚登上豪华的圣特安努号油轮，突然冲过来一位神情着急的老者，听说他的孙女与他走散了。

先到油轮大门右边的客房找到一个躺在床上的水手，与之对话并对战。

之后从楼梯走到船的底层，从右边的梯子上去一直到船长室。小女孩果然就在船长室，可是对话后这孩子竟然又逃跑躲起来了。

赶紧追，于是又在船底层左边的角落找到她，这回逃不了了吧！把孩子带回去找她爷爷。作为感谢，老者将金属外套赠于主角。

这时船也正好抵达了关东地区的枯叶市。一出码头再次见到水君的神现，可惜米那君也依旧晚到一步。

既然来到枯叶市了，那么我们就去拜访一下枯叶道馆。电气系为主的道馆，这个道馆的机关在众多的垃圾桶里，而且机关是随机的，只有连续找到两个关闭电流的机关才能与馆主会面。

然后道馆上方的神奇宝贝俱乐部与会长对话可获得神奇糖果。

下一个目的地—金黄市，从上方的6号道路前行。金黄市右边的民房可获得TM29。

挑战道馆，金黄市道馆以擅长使用超能神奇宝贝为特点，机关的话一直向左右方向的传送点移动最终就会到达馆主所在了。

接着朝金黄市东边的8号道路出发，路上可获得TM41；抵达紫苑镇，到紫苑的广播台与台长对话得知目前广播台电力不足，为停电状态。

现在我们朝着北边的10号道路的岩山隧道前进，路途中可获得TM69；隧道内可获得TM56、复活药片、PP增加药等。