变更后要持变更后的营业执照副本，填写税务变更申请表到税务局办理变更手续，之后才能正常申报。

企业在办理工商注册变更登记手续（领取变更登记的企业法人营业执照）一个月内，向主管税务机关申请办理税务登记证的变更登记。

实际操作中，因为每月10日前需要履行纳税申报，因此，公司应在纳税申报前向主管税务机关提出税务登记证的变更申请，在纳税申报前依法履行变更登记申请的告知义务后，应当说是符合相关法律法规规定的，

其次，一般情况下，主管税务机关在实际了解企业工商登记变更与税务登记变更的间隙期间，不会刻意的刁难企业，与企业过不去的。因此，在这个特定期间，公司的纳税申报只要仍然是依法申报，应该是没有任何问题和担心的。

扩展资料：

(1)纳税人必须依照法律、行政法规规定或才税务机关依照法律、行政法规的规定确定的申报期限、申报内容如实办理纳税申报，报送纳税申报表、财务会计报表以及税务机关根据实际需要要求纳税人报送的其他纳税资料。

扣缴义务人必须依照法律、行政法规规定或者税务在依照法律、行政法规的规定确定的申报期限、申报内容如实报送代扣代缴、代收代缴税款报告表以及税务机关根据实际需要要求扣缴义务人报送的其他有关资料。

(2)纳税人、扣缴义务人可以直接到税务机关办理纳税申报或者报送代扣代缴、代收代缴税款报告表，也可以按照规定采取邮寄、数据电文或者其他方式办理上述申报、报送事项。

(3)纳税人、扣缴义务人不能按期办理纳税申报或者报送代扣代缴、代收代缴税款报告表的，经税务机关核准，可以延期申报。经核准延期办理所规定的申报、报送事项的，应当在纳税期内按照上期实际缴纳的税额或者税务机关核定的税额预缴税款，并在核准的延期内办理税款结算。

参考资料来源：百度百科-纳税申报