1、虽然褪黑素的副作用比较小，但是白天嗜睡、头疼、头晕还是伴随左右的。

2、褪黑素在体内代谢很快，半衰期只有约十分钟，吃完几个小时体内褪黑素水平就和没吃前一样了。

3.褪黑素是一种激素，长期、大量、不按规范服用可能会导致内分泌失调。

1、孕妇、孩童、哺乳妈妈、肝肾功能不全者不建议使用，因相关安全性仍未知；

2、低血压或服用降压药患者勿使用，褪黑激素有降血压功效，可能干扰药物作用；

3、勿与安眠镇静药物（中枢神经抑制剂）合并使用，可能会导致过度嗜睡；

4、勿与咖啡因合并使用，因咖啡因可能会降低体内褪黑激素的水平，若并用会降低补充剂的效果；

5、勿与降血糖药物或胰岛素合并使用，可能会影响控糖药物效力。