朱砂有镇静催眠作用，有解毒防腐作用，外用能抑制或杀灭皮肤细菌和寄生虫。

具有清心镇惊，安神解毒，用于心悸易惊，失眠多梦，癫痫发狂，小儿惊风，视物昏花，口疮，喉痹，疮疡肿毒，心神不宁，心悸失眠，惊风，癫痫，疮疡肿痛，咽喉肿痛，口舌生疮。

用于心神不宁，心悸，失眠。朱砂甘寒质重，专入心经，寒能清热；重能镇怯。朱砂既可重镇安神，又能清心安神，最适心火亢盛之心神不宁、烦躁不眠，

配伍黄连、莲子心等合用，以增强清心安神作用。亦可用治其它原因之心神不宁，若心血虚者，可与当归、生地黄等配伍，如朱砂安神丸；阴血虚者，又常与酸枣仁、柏子仁、当归等养心安神药配伍；惊恐或心气虚心神不宁者，将朱砂纳入猪心中炖服即可。

用于疮疡肿毒，咽喉肿痛，口舌生疮。朱砂有较强的清热解毒作用，内服、外用均效。治疗疮疡肿毒，多与雄黄、大戟、山慈菇等配伍，如紫金锭。治疗咽喉肿痛、口舌生疮，多与冰片、硼砂等配伍，如冰硼散。

用于惊风，癫痫。朱砂有镇惊安神之功。用治高热神昏、惊厥，常与牛黄、麝香等开窍、息风药物同用，如安宫牛黄丸。

治小儿急惊风，多与牛黄、全蝎、钩藤等配伍，如牛黄散。用治癫痫卒昏抽搐，每与磁石同用，如磁朱丸。