1. 病原体感染性心内膜炎病原微生物多为咽喉部、消化道、皮肤部位的常居菌，拔牙、洗牙、牙周手术、扁桃体切除术等菌可导致菌血症。

比如孩子口腔卫生不佳，有牙周病，刷牙常流血，那细菌就有可能顺着牙周伤口流向全身。 大约80%以上的小儿感染性心内膜炎病例是由链球菌和葡萄球菌引起，其中链球菌约占50%，葡萄球菌约占30%。

真菌性心内膜炎的病原体以念珠菌属、曲霉菌属等较多见，多有其他致病因素如长期应用抗生素、皮质激素或免疫抑制剂。 一般情况由一种病原体引起感染性心内膜炎，极少数情况下如接受人工瓣膜手术的孩子可能由一种以上的病原体引起。

2. 易感因素 90%以上的感染性心内膜炎孩子有原发心脏病变，其中以先天性心脏病最为多见（80%～90%），先天性心脏病中以室间隔缺损、动脉导管未闭、主动脉瓣狭窄等多见，很少见于继发型房间隔缺损。

先天性心脏病的孩子由于存在心脏结构的畸形，容易引起血流动力学的改变，使得细菌容易在损伤部位繁殖。 后天性心脏病也可并发感染性心内膜炎，其中风湿性瓣膜病占14%，通常为主动脉瓣及二尖瓣关闭不全。 随着小儿心脏外科技术的发展，越来越多的小儿心脏病得以纠正和根治，但因此而置入心脏的装置或材料也增加了感染性心内膜炎的风险。