流程如下：

一、提交个人辞职申请、《事业单位工作人员辞职申请表》，均需院系部处领导签字盖章;

二、报人事处提交请示报医院主管领导审批、发文公布;

三、领取同意辞职文件、离院通知单，办理离院手续;

四、至综合科办理社保视同缴纳证明;

五、提交调档函(注明接收单位地址、邮编，接收人姓名及联系方式)，人事处将个人档案寄出。

一般的劳动者按照我国劳动合同法的规定办理就可以，但你是事业单位的在编人员，在辞职方面不能完全适用劳动劳动法的相关规定。

各地一般有各地区的《事业单位聘用合同办法》，根据大部分地区的法律、法规和规章的规定，如果你辞职的原因不符合相关《办法》规定的情形，你需要和单位协商一致解除聘用合同。

协商解除达不成一致，受聘人员应当继续履行聘用合同;一定期限后再次提出解除聘用合同仍未能与单位协商一致的，可以单方面解除合同。

另有规定的，从其规定。也就是说，如果你辞职原因不存在可以随时解除聘用合同的法定事由，单位要求你提前一定期限书面通知辞职是符合法律规定的。

至于违约金问题，若单位已经同意你辞职，你应该按照单位的相关规定对工作进行交接，之后单位会给你出具终止聘用合同的有效证明。

并按照国家和本市的规定与你结算工资、予以办理社会保险关系封存或者转移的手续。劳动合同中没有约定违约金的问题也就不需要给付。

事业单位在编人员辞职问题：

事业单位在编职工辞职按照《全民所有制事业单位专业技术人员和管理人员辞职暂行规定》(人调发〔1990〕19号)等相关规定办理。

首先是在编职工向所在单位或主管部门提出辞职书面申请;所在单位或主管部门收到辞职书面申请后，一般应在三个月内，给予书面批复，对批复同意的发给辞职者本人辞职证明书。

事业单位在编职工与所在单位订有聘用合同的人员，其辞职按照聘用合同的有关规定办理。辞职经批复同意后，辞职其本人协助用人单位办理档案托管、社保等相应的人事手续。

参考资料来源：

百度百科-事业单位人事管理条例

百度百科-《全民所有制事业单位专业技术人员和管理人员辞职暂行