发酵床的垫料要有一定的惰性，不能够容易被分解，垫料的主要成分以木质素为主为最好，因为发酵床的主要功能就是分解粪便而不是分解发酵发酵床的垫料。

发酵床的垫料一定要粗细搭配，既不能全部用很细的锯末，也不能全部使用稻糠，既要保证垫料的透气性，又要保证垫料的吸水性能，只有这样的垫料才符合发酵床的要求。

发酵床的垫料要有着一定的吸水性能，例如一斤的混合发酵床垫料至少要能够吸附一斤左右的水不往外淌，这样的要求就使得精细垫料原料要占据一定的比例。

发酵床的垫料要有一定的硬度和刚度，这样才能够不容易板结，而稻草这一类的面料就容易板结，并且可以增加发酵床垫料的透气性。

垫料的混合一定要注意粗细搭配，垫料的粗细程度不能够太细，也不能够太粗。如果垫料太细的话，就容易板结，空气进不到里面去而粪便发酵是好氧发酵，如果不透气，那么粪便的分解效果就达不到理想效果；如果发酵床的垫料比较粗，那么发酵床的垫料吸水性能就不会太好不能够为微生物创造一个良好的发展环境。

发酵床垫料是不能够使用花生壳作为原料的，主要原因是花生和特别容易被黄曲霉菌寄生，很容易造成出行的霉菌毒素中毒，这样就会造成极大的经济损失。

冬天多用疏松透气性好的垫料原料，夏季则相反。