一、概念不同

1、机械设计制造及其自动化：是研究各种工业机械装备及机电产品从设计、制造、运行控制到生产过程的企业管理的综合技术学科。

2、机械工程及自动化：以有关的自然科学和技术科学为理论基础，结合生产实践中的技术经验，研究和解决在开发、设计、制造、安装、运用和修理各种机械中的全部理论和实际问题的应用学科。

二、课程设置不同

1、机械设计制造及其自动化：机械制造工艺学、机械系统设计、机电控制系统分析与设计、机械制造装备设计、数控技术及应用。高等数学、线性代数、概率论与数理统计、大学物理、大学物理实验、普通化学及实验、工程图学、理论力学、材料力学、电路基础。

机械原理、机械零件、电子技术、互换性与技术测量、工程材料、金属工艺学、测试与传感技术、制造技术基础、液压与气动技术、机电传动控制、机械工程综合实验、微机原理与结构技术、CAD/CAM、单片机原理及应用。

2、机械工程及自动化：工程力学、机械设计基础、电工与电子技术、微型计算机原理及应用、机械工程材料、制造技术基础。

现代企业管理；测控技术；机械工程实验（II）；机械控制工程理论基础；精密加工技术；流体传动与控制；生产实习；装备与制造技术基础；数控技术；机械工程计算方法；材料成形技术基础；现代加工。

三、就业方向不同

1、机械设计制造及其自动化：机械产品的生产，如生产设施的规划和实现、生产计划的制订和生产调度、编制和贯彻制造工艺、设计和制造工艺装备、确定劳动定额和材料定额以及加工、装配、包装和检验等。机械制造企业的经营和管理，如确定生产方式、产品销售以及生产运行管理等。

2、机械工程及自动化：从事机械设计与制造加工工艺规程的编制与实施工作； 从事机械、电气、液压、气压等控制设备的维护维修工作； 从事工艺工装的设计、制造工作； 从事数控机床、加工中心等高智能设备的编程及操作工作； 从事机械CAD/CAM技术的应用工作；

参考资料来源：百度百科-机械工程及自动化

参考资料来源：百度百科-机械设计制造及其自动化