细菌全基因组具有相对较小、重复序列较高、易于突变等特点，所以很必要对微生物进行全基因组测序。细菌de novo测序已取代传统方法成为研究细菌进化遗传机制，关键功能基因的重要工具。 目前，细菌全基因组测序使用三代测序可以得到0 Gap完成图；精确检测结构变异、可移动元件；获得全基因组6mA、4mC表观遗传图谱。工具/原料moreDNA抽提试剂盒建库试剂盒 三代测序仪：Pacbio RSⅡ 或 Pacbio Sequel基因组分析组装软件方法/步骤1/4分步阅读

一、技术路线

2/4

二、生物信息分析

1. 原始数据质量评估

2. 基因组拼装组装

3. KEGG、eggNOG、GO注释

4. 系统发育树

5. 基因家族分析

6. 亚细胞定位

3/4

三、结果展示

1. 数据库使用

Refseq

eggNOG

2. 版图展示

图1.1所示，绘制细菌全基因组圈图；

4/4

图1.2所示，全基因组甲基化图谱；

注意事项

样本要求： DNA总量〉10 µg；浓度〉100 ng/µL；260/280为1.8~2.2

三代测序细菌基因组