法院拍卖的车违章扣分处理方式：将涉及该车的道路交通安全违法行为和交通事故处理完毕即可。通过司法拍卖的车辆在过户过程中，出现买受人需承担违章扣分的现象。在申请转移登记前,应当将涉及该车的道路交通安全违法行为和交通事故处理完毕,但因实际驾驶人无法确定,可仅对机动车所有人处罚,不予记分。

车辆违章扣分由买受人承担有悖于《道路交通安全法》立法精神。

对于驾驶人的违章行为应予以扣分、罚款处罚，其目的是为了警示驾驶人安全行车，维护文明的驾驶秩序，而车辆买受人并非实际违法者，对其进行处罚不但有违公平正义原则，而且还不能真正处罚到违法者，显然与《道路交通安全法》的立法宗旨相违背。

机动车驾照所有的12分具有人身性和专属性。扣分和罚款不同，现行拍卖中拍卖公告在披露的情况下，买受人愿意对罚款进行处理有一定的合理性，相对于扣分而言，金钱不具备专属性和人身性，这个人交钱和那个人交钱都是一样的效果。

况且对于违章罚款，可以从拍卖所得案款中优先进行支付。但是扣分则不同，可扣分数具有专属性和人身性，具有人身性和专属性的特性往往是不可替代的，更不能进行强加。免除扣分起不到处罚效果。

这种方式虽不需要买受人承担，也利于车辆过户，但是将违章扣分的事实进行免除，一是没有法律依据，二是不能达到扣分的效果。

扣分的处罚是为了纠正驾驶人员的不文明行车行为，对道路安全的重要保障作用，而处罚的对象应当是违法者本人以起到警示作用，所以违章扣分应当由原车辆驾驶人员或者所有人进行承担。

第七条已注册登记的机动车所有权发生转移的，应当及时办理转移登记。

申请机动车转移登记，当事人应当向登记该机动车的公安机关交通管理部门交验机动车，并提交以下证明、凭证：

(一)当事人的身份证明；

(二)机动车所有权转移的证明、凭证；

(三)机动车登记证书；

(四)机动车行驶证。

参考资料：道路交通安全法—中国政府网