区别如下：

1、强光照射

强光照射时，可以看出南红内部有无数个朱砂点。南红玛瑙中的朱砂点：为硫化汞，呈红色，当朱砂点分布细密，大量聚集时就会呈现南红玛瑙现在的红色，且越细密，数量越多就越红艳。

比较透一点的料，在白天或光照下，用眼睛直接是可以观察到朱砂点的。如果是玉质感强透光性差的灯光打不通透的，可以用强光手电在表面上贴近看，一样可以看到一个个颗粒状紧密排列的物质，这个颗粒状的物质就是南红玛瑙中的朱砂，这个是其它玛瑙不具备的特点也是其独有的特点。

2、颜色上看

南红与红玛瑙两者颜色相仿，但南红的红更为鲜艳美丽，普通红玛瑙无法与之比较。我们看到的极品南红一般都是颜色正，特别是锦红是南红中的帝王之色，价值不言而喻，且非常稀少，当然拿来收藏升值空间也是很大的。

3、质地上看

南红虽属于玛瑙，但其特性更接近于玉，南红胶质感强，而玛瑙则类似玻璃质感。因此南红也叫赤玉，长期佩戴，会有和田玉般温润，令人爱不释手，普通红玛瑙根本不能与其相提并论。

4、油性上看

南红具有一定的油性，把玩之后的效果更甚于普通玛瑙，特别是保山南红，佩戴盘玩后更加红润油亮。

5、产地

南红玛瑙就是在南红地区产的玛瑙，就是现在的云南南红，还有很多其他地区出的，要仔细分辨看纹理，南红玛瑙都是老南红，由于长期使用会形成风化纹，冰裂纹等。

除了以上几点比较直观的特征外，我们还可以从原石上区别两者，南红往都是外部红肉内部可能有冻肉，相反玛瑙的内外结构一致，因此南红开原石的风险较之玛瑙更高，这也是南红价值高于玛瑙的其中一点。