当百香果幼苗定植成活后，在幼苗期应插立支柱，以便引诱主蔓上棚架。通常留1~2条主蔓上架，剪去过多侧枝，短期内枝蔓就可长满棚架。待主蔓1米高时剪除顶芽，让其长出侧蔓，每侧留2个侧蔓，分向两侧生长，当侧蔓长至2米时，将侧蔓顶端剪除，以促进次生侧蔓生长。若是水平棚架栽培时，应等主蔓到达棚架上时，留侧蔓向四方平均生长。

百香果一级蔓是主要营养枝，二、三级蔓是主要结果枝，所以培育健壮的二、三级蔓是提高产量的重要一环。

百香果一般每批果采收后，每个侧蔓留3-4节进行短截，促其重新长出侧蔓，同时每年夏季必须疏剪生长过密的枝条，或将垂下拖延地面的枝条，离地面约20-30厘米处剪除，以保持通风良好。

百香果冬季修剪一般安排在最后一批果实成熟收获后，以主枝为中心，一侧留50厘米左右进行修剪。

缠在棚上的枝条卷须要全部去除。二是常规修剪，采果后的结果枝、瘦弱枝、病虫枝、残枝及时剪去，在枝蔓上留2个芽眼；及时抹去架面下主蔓及基部所发出的侧芽嫩枝。重剪后马上萌发出的新梢就能成为很好的结果枝。

修剪清园后要加固棚架，并用70%甲基托布津可湿性粉剂100倍稀释液涂抹茎基，以防治茎基腐病。

百香果忌重剪，每年无须强剪。若过度修剪，易使主蔓逐渐枯萎，严重时整株死亡。