由于蜂蜜本身的酸性（通常PH在4以下，算中强酸性了），所以蜂蜜的保存一定不能用铁、锌等金属器皿，以防止重金属污染。普通消费者购买量较小时，用无毒塑料、玻璃都可以。

由于蜂蜜是糖的过饱和溶液，具有极强的吸湿性，所以蜂蜜的保存一定要密封完全，如果没有密封好，会导致蜂蜜浓度降低，含水量增加，容易发生蜂蜜发酵的问题。因此，在消费者在购买过程当中请注意购买1斤或者2斤装的，随吃随买，以避免吸水后发酵的问题发生。另外，用勺子从蜂蜜当中舀出蜂蜜时也要同时保证勺子的干燥，以避免过高的使用频率导致蜂蜜吸水后发酵。

不少消费者喜欢喝非结晶的蜂蜜，所以特别注意蜂蜜保存的温度，在13－14℃时蜂蜜最容易结晶，高于或者低于都没有问题。如果特别在意是否结晶的消费者，请注意蜂蜜的保存温度。

防吸收水分和异味：据试验，将蜂蜜露置于相对湿度为81％的室内，3个月后水分能增加到82%。因此，即使是成熟蜜，如不注意，也会吸湿而发酵。蜂蜜最好用密封性好的瓷器盛装，置于于燥、通风的室内。保存最适温度是5--10℃或27℃以上。若容器不能密封，保存室内绝不可同时存放带有强烈气味的物品，以防蜂蜜吸收异味。

蜂蜜最好都放在冰箱当中冷藏保存，虽然蜂蜜天然具有抗菌性，但时间久，有水分进入蜂蜜当中，温度较高容易导致变质。

如果蜂蜜结晶之后，请不要直接加热让蜂蜜从结晶状态变为非结晶状态，否则容易因温度过高造成营养流失。