Materials Studio(MS)如何使用氢原子饱和
来源:网络收集 点击: 时间:2024-08-17【导读】:
构建或编辑一个结构常常涉及到改变结构的化学性质。一个特定类型的元素可以被不同的元素所取代,键的顺序可以被改变,或者一个原子可以被杂化。这样的变化可能需要重新评估连接到一个地点的氢的数量;氢的数目可能不再合适,例如,由于价或形式电荷的变化,或者由于杂化或相邻原子的局部几何变化,氢原子的位置可能不正确。工具/原料moreMaterials Studio(MS)方法/步骤1/6分步阅读
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智能仪器计算物理分子建模MS软件原子尺度
在素描工具栏上的调整氢按钮提供了一个方便的机制来重新计算选定的非金属原子上氢原子的数目和位置。

氢的数量是根据几个因素来计算的: 常见的氧化态、杂化、形式电荷、键的数量和顺序

如果选择的非金属原子的氢原子太少,就会增加额外的氢。现存的氢被保留了,尽管它们的位置可能会改变。如果有太多的氢,一些现有的氢就会被删除。中心(非氢原子)的原子永远不会被删除。
氢原子的位置是由原子的杂化和它结合的原子的数量和位置控制的。

氢原子自动更新
自动更新的氢指令会使氢在发生化学结构变化时被重新评估。

晶体结构
当在晶体结构中改变氢的时候,对称性就成为了一个重要的因素。如果非金属原子处于一个特殊的位置,就不可能计算出氢原子的位置。然而,在一般的对称位置上,氢原子可以重新计算。
6/6删除氢:
若要删除所有氢,在一个氢上双击一个氢键来选择所有的氢。删除有如下方法:
按删除键
右键单击3D结构文档并从快捷菜单中选择Delete
从菜单栏中选择Edit Delete

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