新农合和学生儿童保险可以分开报销。

新农业合作医疗保险与校园学生儿童保险是两种不同性质的险种，只要符合保险责任，都是可以申请报销的。

保险的医疗是以不获利为原则，如果用其中的一种报销了，所报部分，在另一种保险里是不能重复报销的。

报销的原则，因为社保对于报销时间以及报销票据方面的更加强制性，最好先用社保进行报销，再用商业保险报销。

学生疾病住院医疗保险理赔注意事项

1、学生因疾病就医必须在县级以上的公立医院。

2、保险的责任、责任的免除及其他相关事宜，参照于保险公司签订的保险协议执行。

3、新生保险，自合同生效之日起，因疾病住院必须经过1-3个月的观察期，期满后如属于保险责任的范围方可理赔。

4、学生准备材料：病例、出院小结、用药清单、住院发票、报告单、身份证复印件（正反面）及保险公司指定的其他材料。

5、学生填写好理赔申请书后由学工处将所有材料递交给保险公司业务员，并做好登记。

6、签收保险公司业务人员递交的理赔款，并通知学生领取。

7、将理赔情况做好登记备档。

参考资料员：

百度百科-学生保险

百度百科-新型农村合作医疗