最近小编收到很多问题，其中一个就是下面小编为大家整理一下关于选择压力分析方法的步骤，希望这些方法能够帮助到大家。方法/步骤1/6分步阅读

首先，基因的进化速率受到纯化(负)选择、突变和定向(正)选择等因素控制。为了检验选择压力对虾虎鱼亚目类群mtDNA的影响。

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然后，通过Geneiousv.5.4对所得序列进行严格多重序列比对分析，然后利用DnaSP5.071与PAML18]软件，估算其非同义替换率(Ka)和同义替换率(Ks)的比值(Ka/Ks)。

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然后，基因差异性分析，对mtDNA蛋白编码基因进行基因变异位点分析。先通过Geneiousv.5.4软件，比对10种虾虎鱼亚目鱼类的蛋白编码基因，然后利用DnaSP5.0软件分析这些蛋白编码基因的变异位点与变异特征。

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然后，系统发育学分析，选择压力分析与基因差异性分析结果，选择备选分子标记基因。先利用Geneious v.5.4 对所选基因序列进行严格多重序列比对分析，再以jModel Test 2。

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然后，评估所有位点的最适置换进化模型，并以AIC(Akaikeinforma-tioncriterion)参数值评价所选模型的优劣。

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最后，通过Neighborjoining方法构建先验基因树，用Geneiousv.5.4和Megav.5.0进行最大似然法(MaximumLikelihood,ML)系统发育分析，自举支持度值(bootstrapanalysis)取1000。

注意事项

上述方法为小编整理所得，希望能够帮助到大家。

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