黑木蕨在原产地是攀附生长在岩石上的蕨类水生植物，黑木蕨的根部与其他的水草相比较，就会发现明显有别。为了适应独特的生存环境，黑木蕨的根部显得坚硬而细长，并且木质化程度也很高，几乎与陆地生长的植物的根部没有什么两样。

也就是说，黑木蕨的根部细胞形小而细胞壁厚，并且细胞间隙小、气室不发达。

类似这种构造的根系通常只适合在通气良好的基质上栽培，否则极易因发生缺氧情况使根部无法正常呼吸而“闷死”，最终直接导致根部腐烂。因此一般情况下可将其用鱼线捆绑栽种在沉木、岩石上养殖。

若希望将其贴近底沙养殖，可在将其捆绑在火山石上后将火山石下部埋入沙子，保证横状根茎露出沙面即可。

水下养殖黑木蕨时应当注意控制水温在20至28之间，否则容易黑叶腐烂。对肥料需求较低，一般只需少量添加液肥即可。

此外值得注意的是，黑木蕨在水下养殖移栽时由于环境的变化，原有的叶片会大量发黑死亡。

这是正常现象。在环境基本符合上述养殖要求的前提下不用处理，保持环境稳定的情况下约2——3周即会萌发新叶，待新叶茂盛后再剪去发黑的叶片即可