大多数春季大棚番茄小苗不发根是由于温度过低的原因引起的，温度低，特别是地温低，番茄生长慢，根系生长受到抑制，发棵缓慢。这种情况，要尽力提高棚内温度，有条件的，可以在春季大棚上面加保温被，加强夜间保温。

有时土壤施肥过多，特别是施了未充分腐熟的有机肥，造成了根系烧根现象，番茄根系新根受到影响，也会造成发棵困难。

有时为了防止番茄苗期徒长，过于控制浇水，土壤过于干旱，也会发棵困难和缓慢。

有时棚内浇水过多，造成地温过低，也影响新根的生长，严重时会沤根，死棵。

土壤板结、盐渍化重，特别是在一些常年施用大量肥料的地块易出现，土壤溶液浓度过大，新根生长受到影响，会引起发棵困难。

防止春季大棚番茄小苗不发根，就要尽量提高棚温，实行全地膜覆盖，并用膜下暗灌法进行浇水或用膜下滴灌，不要大水漫灌。要尽量多施一些充分腐熟的牛羊糞，以疏松土壤，也可提高部分地温。