原始合作和互利共生的区别是指不同种的两物体间的一种互惠关系，分开以后都不能独立生活。原始合作是两种生物生活在一起，互相受益，但二者之间不存在依赖关系，可以分离开来各自发展。不同点是前者互利共生是不可分的，是互惠关系，原始合作可分可合，不存在依赖。

互利共生表现为对双方都有利，发展到彼此不能离开而独立生存的程度，属于专性的共生，例如白蚁及其肠道内的鞭毛类；互惠共生和互利共生概念基本一样，只是没有彼此生物还可以存活，属于非转性寄生。

互利共生是不同种两个体间一种互惠关系，可增加双方的适合度。可分为以下几类。

1、共生性互利共生：生物体以紧密的物理关系生活在一起，如菌根（真菌和植物的根）非共生性互利共生：包括不生活在一起的种类，如清洁鱼和“顾客”鱼。

2、专性互利共生：在永久性成对组合的生物中，一方或双方不能独立生活，如地衣（真菌-藻类）、珊瑚（珊瑚虫-藻类）兼性互利共生：共生者可能不相互依赖着共存，如豆科植物和根瘤菌、蜜蜂和植物传粉。

弗氏放线菌与沙棘（根瘤固氮）、蓝细菌与蕨类植物（非结瘤固氮）注意：某些动物散布种子（埋在动物毛发中的刺果）对动物没有利益，不是互利共生。

3、防御性互利共生：其中一方提供对捕食者或竞争者的防御，如蚂蚁-金合欢树。

4、动物组织或细胞内的共生性互利共生：白蚁和肠道细菌。