KOBAS软件的使用
来源:网络收集 点击: 时间:2024-02-18【导读】:
KOBAS主要用于对基因进行KEGG注释工具/原料more一台可以连接互联网的电脑等待注释的基因序列或者蛋白序列或者基因编号方法/步骤1/7分步阅读
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注意事项
通过百度找到KOBAS网站

注册账户。可以不注册。但是注册之后可以保存你的输入文件和分析结果文件,有利于后面的查询。

注册之后,就可以使用用户名登陆了。当然,如果你之前已经有用该用户名进行数据的分析,那么你可以查询到你过往的数据分析结果。


基因的注释。输入的可以是基因的序列,也可以是编码蛋白的序列,也可以是NCBI上的gene ID等等。输入文件可以从已经上传到网站服务器的文件中选择,也可以直接粘贴到对话框,也可以选择新上传文件。下面的框框中选择你要比对的数据库,修改输出的文件名,点Run就可以了。

结果出来之后(如果你的序列很多的话,可能需要一天或者几天的时间,如果只有一个的话,几分钟甚至几十秒就可以了)。点击gene ID的连接,可以了解更多的情况。


Annotate + Identify中,则可以对输入序列进行注释之后,对他们进行富集聚类。方法与Annotate大同小异。

由于该网站规定最多一次注释序列500条。因此可以选择下载脚本创建本地版分析软件。

最多只能一次使用500条基因序列。
最多只能同时执行5个任务。
服务器拥挤的时候,需要排队。
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