我们打开HLM的主界面，最上面的工具栏就是我们用到的主要菜单，首先file下面我们可以创建新的hlm/mdtm文件（hlm中最重要的文件），如下图，假如我们已经建立好了HLM的MDM文件，那么我们在下次打开的时候需要选择make new mdm from old mdm files，HLM不能直接打开之前的文件，可以从之前的MDM文件中运行。我们需要新建立一个HLM处理，点击如下图，一般如果数据是存在SPSS或者STATA，SAS中的选择stata package input

然后我们会看到如下界面，我们一般用的就是2层，假如数据位3层结构，选择HLM3，假如因变量为多个，可以选择下面的MULTIVARIABLE。

建立文件的界面主要如下图，区域1和区域2是MDM文件的名称与保存，两个名称可以不一样，但是不能空着。区域3是数据类型的选择，假如数据位人嵌套在组中，选择第一个，假如是追踪数据的多个时间点测量，选择第二个。区域4是水平1的界定，区域5是水平2的界定。选择已经在SPSS中编辑好的数据，然后界定第一层的变量和第二层的变量（详见下篇经验）。最后先make mdm 然后我们可以检查MDM，出来一些描述性的结果，如下图2，然后我们点击DONE

点击之后出现下面的界面，水平1的数据下包括右下方的所有变量。然后我们点击因变量，将其设定为产出变量，假如本数据中score为因变量，左击score，选择outcome variable。

然后左击自变量，有三种方式，一种是没有中心化的，一种是组中心化的，一组是总体中心化的数据，根据数据类型进行选择，一般假如是原始数据的话选择没有中心化的。

再者，我们有时候需要将第二层的某些方程中的随机效应改为固定效应，这个时候在HLM6.0中的操作非常简单，只需要将你所需要固定的随机变量点击变为灰色即可，如下图

然后继续设置第二层的变量，如上一样，注意设置哪个方程首先需要点击一下该方程。

然后我们就可以运行该程序了。我们也可以先保存再运行，运行之后的结果默认会以hlm2为文件名的txt文档保存在MDM文件所放置的文件夹中。