1，收费不同。

单笔付款一般没有手续费，原本网银跨行转账要收手续费，手续费转账人出，两千元以下柜台2元一笔AT机2.4元一笔，但商业银行网络金融联盟建立后就不收了。

2，转账过程不同。

单笔付款可以是同一银行之间账户转账，跨行转账必然涉及到两家银行，转账记录在两家银行都有记录。

3，面向对象不同。

单笔付款付款对象是建行用户，跨行转账付款对象是其他银行。也就是说单笔付款必然是不跨行的，跨行就成了跨行转账了。

扩展资料：

中国工商银行、中国农业银行、中国银行、中国建设银行、交通银行五家银行刚刚联合宣布，今起陆续对客户通过手机银行办理的转账、汇款业务，无论跨行或异地都免收手续费。并承诺，对客户5000元以下的境内人民币网上银行转账汇款免收手续费。

继工商银行、农业银行、中国银行、建设银行、交通银行五大国有银行宣布手机银行转账免收手续费之后，日前，又有12家全国性股份制商业银行加入跨行转账免手续费的队伍。

12家银行有：中信银行、招商银行、浦发银行、光大银行、华夏银行、民生银行、广发银行、兴业银行、平安银行、恒丰银行、浙商银行、渤海银行，首任联盟主席行为中信银行。

参考资料来源：凤凰网-五大银行宣布今起手机银行转账汇款免收手续费