细菌芽孢需采用加温染色法细菌的芽孢具有厚而致密的壁，透性低，不易着色.所以，除了用着色力强的染料外，还需要加热，以促使芽孢着色。因此芽孢不是细菌的繁殖体。

芽孢，是某些特殊种群的细菌，主要是芽孢杆菌属Bacillus与梭菌属Clostridium中细菌产生的特殊休眠体，有极强的抗逆性，对热、碱、酸、高渗以及辐射均有强耐受性。

普通的巴斯德消毒法无法杀灭芽孢，通常使用的杀灭芽孢的方法为高压灭菌。一个细菌产生一个芽孢，条件适宜时重新成为一个细菌，数量没有增加。