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    基因进化树构建前期准备-基因组序列查找和保存

    来源:网络收集  点击:  时间:2024-05-13
    【导读】:
    基因组进化树构建之前需要收集至少4组基因组序列才能进行后面的基因比对和进化树构建。今天来讲解一下基因进化树构建的前期准备,基因组序列的查找和保存。工具/原料moreNCBI百度方法/步骤1/7分步阅读

    首先,点击百度,输入NCBI,弹出如下对话框,点击第一个,进入NCBI。

    2/7

    将all databases 改成nucleotide,如图所示

    3/7

    在空白处搜索你想要的基因序列名称,这里选择TH11(新型鸭呼肠孤病毒中的一种),弹出如下框所示界面,这里想要构建TH11的L1基因组序列的比对情况,所以继续下拖,选择TH11的L1区段全基因组序列,如下图所示。

    备注:这里也可以选择基因登陆号搜索你要的基因组序列,比如GenBank: JX826587.1)(新型鸭呼肠孤病毒中的一种)

    4/7

    完成上述步骤后,点击进入,弹出如下对话框,

    5/7

    完成上述步骤后,然后点击FASTA,弹出基因组序列。

    6/7

    按上述步骤依次找到其余你想要序列。这里选择了Muscovy duck reovirus strain J18 segment L1, complete sequence;KJ879924.1 Duck reovirus SD-12 segment L1, complete sequence;Duck reovirus strain 091 segment L1, complete sequence;Avian orthoreovirus strain S1133segment L1, complete sequence;KY418032.1 Muscovy duck reovirus strain MW9710 segment L1, complete sequence;这里也可以选择基因登陆号搜索你要的基因组序列

    7/7

    将你找到的基因序列如图所示,将其选中,然后在桌面新建一个txt文档,将其复制粘贴到txt文档里面,做好文档名称的标记

    New Roman;font-size:14px;mso-font-kerning:1px; 1、按上述步骤依次找到其余你想要序列。这里选择了Muscovy duck reovirus strain J18 segment L1, complete sequence;KJ879924.1 Duck reovirus SD-12 segment L1, complete sequence;Duck reovirus strain 091 segment L1, complete sequence;Avian orthoreovirus strain S1133segment L1, complete sequence;KY418032.1 Muscovy duck reovirus strain MW9710 segment L1, complete sequence;

    注意事项

    基因进化树构建至少需要4个基因组序列才能进行比对构建进化树

    本文关键词:

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