基因进化树构建前期准备-基因组序列查找和保存
来源:网络收集 点击: 时间:2024-05-13首先,点击百度,输入NCBI,弹出如下对话框,点击第一个,进入NCBI。


将all databases 改成nucleotide,如图所示


在空白处搜索你想要的基因序列名称,这里选择TH11(新型鸭呼肠孤病毒中的一种),弹出如下框所示界面,这里想要构建TH11的L1基因组序列的比对情况,所以继续下拖,选择TH11的L1区段全基因组序列,如下图所示。
备注:这里也可以选择基因登陆号搜索你要的基因组序列,比如GenBank: JX826587.1)(新型鸭呼肠孤病毒中的一种)


完成上述步骤后,点击进入,弹出如下对话框,

完成上述步骤后,然后点击FASTA,弹出基因组序列。

按上述步骤依次找到其余你想要序列。这里选择了Muscovy duck reovirus strain J18 segment L1, complete sequence;KJ879924.1 Duck reovirus SD-12 segment L1, complete sequence;Duck reovirus strain 091 segment L1, complete sequence;Avian orthoreovirus strain S1133segment L1, complete sequence;KY418032.1 Muscovy duck reovirus strain MW9710 segment L1, complete sequence;这里也可以选择基因登陆号搜索你要的基因组序列





将你找到的基因序列如图所示,将其选中,然后在桌面新建一个txt文档,将其复制粘贴到txt文档里面,做好文档名称的标记
New Roman;font-size:14px;mso-font-kerning:1px; 1、按上述步骤依次找到其余你想要序列。这里选择了Muscovy duck reovirus strain J18 segment L1, complete sequence;KJ879924.1 Duck reovirus SD-12 segment L1, complete sequence;Duck reovirus strain 091 segment L1, complete sequence;Avian orthoreovirus strain S1133segment L1, complete sequence;KY418032.1 Muscovy duck reovirus strain MW9710 segment L1, complete sequence;


基因进化树构建至少需要4个基因组序列才能进行比对构建进化树
版权声明:
1、本文系转载,版权归原作者所有,旨在传递信息,不代表看本站的观点和立场。
2、本站仅提供信息发布平台,不承担相关法律责任。
3、若侵犯您的版权或隐私,请联系本站管理员删除。
4、文章链接:http://www.1haoku.cn/art_749722.html