防治水体污染：水体营养化是凤眼蓝不断繁殖生长的根基，要从源头上来防治凤眼蓝的泛滥。由于人们生活水平大幅度提高及人口不断膨胀，生活污水排放量及有机物含量大大提高，为凤眼蓝的生长提供了重要的营养源，所以要控制生活污水的排放，以及工农业废水的有序排放，确需排放时必须经无公害化水处理后再排放。

机械搅灭法：对凤眼蓝危害较大的水域，可以使用相关机械将其搅灭打碎，扩大水体的光照面积，增加水体的流动，确保养殖、捕捞及航运顺利进行。

人工清除法：动用人力物力直接将凤眼蓝捞起运送到陆地而予以清除。这也是期初用得最多的方法，针对小水面实施效果较佳。如果水域过大，则人力物力代价太大，不建议使用。

化学防治法：如果在稻田田埂或蔬菜空茬田，每667平方米使用20%使它隆乳油50毫升，可兑水喷雾。每667平方米使用20%使它隆乳油25毫升加20%二甲四氯钠盐水剂125毫升加洗衣粉7克，混合喷雾，可降本增效。果园、矮化银杏林及草坪地可使用上述药剂进行定向喷雾。如果是河道、池塘、沟渠边，每667平方米使用41%农达水剂300-400毫升、灭草烟30克、百草枯60克或36%草甘·氯磺可溶性粉剂300克，兑水20千克喷细雾，使药液黏附在水花生茎叶上。严格注意不能在饮用水水面进行，且须注意人畜、鱼类的安全

生物防治法：在晚春或初夏，最低气温稳定回升到13℃以上时，每667平方米释放凤眼蓝象甲成虫1500-2000头。可以达到一定的防治目的。

变废为宝法：可以利用凤眼蓝来制作猪或鱼饲料，一般做法是将凤眼蓝粉碎打浆，再加入2%的食盐拌匀，再用它喂猪或养鱼，也可用来培肥水质。