处理方法如下：

1、学校或老师并非行政机关或执法人员，没有执法权，无权扣留或没收公民的个人合法财产

2、即便老师的做法，是为了学生的学习。但是当时没收之后，应当积极联系学生家长，将手机返还给家长，与其交涉提高学生学习积极性的方式和方法。方为正确的处理方式。

3、老师以任何理由将学生的手机长期扣留，并于学生毕业后方返还，都属于侵占他人合法财产的违法行为。

4、按照刑法270条的规定，将他人的代为保管物、遗忘物、埋藏物非法占为己有、经讨要后拒不归还，数额较大的，构成侵占罪。

处2年以下有期徒刑、拘役或罚金数额巨大或有其他严重情节的，处2年以上5年以下有期徒刑、并处罚金目前，最高法尚未就侵占罪数额认定给予详细规定，各地一般以人民币5000元作为数额较大的认定标准。侵占罪，系刑事自诉罪。

符合起诉条件的，当事人可以直接搜集证据，向人民法院提起刑事自诉，并要求返还手机。

5、如果手机的价值不足5000元，仅为民事纠纷，当事人可以依法向人民法院提起诉讼，要求老师返还手机。司法依据《中华人民共和国刑法》270条司法依据《中华人民共和国民法通则》92条