克拉霉素干混悬剂安全性很高，因安全性高所以做成了孩子专用的剂型，但克拉霉素也有一定副作用。常见的不良反应有胃肠道反应，如腹痛、腹泻、呕吐等，孩子出现不良反应可以在吃药之前吃点东西。很少一部分孩子服药之后会出现牙齿颜色的改变，一旦出现可以通过口腔医生的处理解决。需要注意克拉霉素与降糖药、胰岛素合用时，会导致低血糖的发生。与抗癫痫药或免疫制剂合用时，克拉霉素会使血药浓度升高。