菜花容易生菜虫，在生长的过程中，有些人为了减少菜虫对菜花的残害，会喷洒大量的农药，再加上菜花表面凹凸不平，更易积蓄农药残留，因此在烹调菜花前，一定要将菜花清洗干净，具体的清洗方法可以将菜花放在盐水中浸泡五分钟，这么做可以使残留的农药和菜虫得到清除。

吃菜花时要注意搭配一些食材，这样更加的健康，因为菜花在肠胃中分解后容易引起胀气。不过，如果在烹调菜花时加一些大蒜、胡椒、小茴香等辛辣调料，便可以大大减少胀气的不适，还有利于增进食欲，帮助消化。

烹调菜花的火不能过大，因为菜花不耐烧煮，宜急火快炒，尽量选择短时间加热的方法，断生之后马上盛出，这样才能保持清香脆嫩的口感，使营养素与抗癌成分不致破坏和丢失。而且菜花切好之后不能久放，因为在室温空气中放置6小时后，其抗癌成分的损失率可达75%之多。

注意食材的搭配。菜花中含有少量导致甲状腺肿大的物质，经常食用者应注意补充碘，如加入碘盐或食用海藻等海味食物。另外，菜花不宜与猪肝和黄瓜同食。菜花纤维中的醛糖酸基容易与猪肝中的铁、锌等微量元素发生反应，因此两者同食会导致人体对这些元素的吸收大大降低；猪肝中的铜、铁元素还会使菜花中的维生素C氧化为脱氢抗坏血酸，失去原来的功效。所以烹调菜花一定要选对搭配的食材。