飞鱼起飞时，先将胸鳍和腹鳍紧贴在身体上，摆动尾鳍，加快游动的速度。当头部露出水面时，飞鱼马上张开胸鳍，快速摆动尾鳍，使身体上升。

当鱼体全部跃出水面后， 飞鱼又将腹鳍张开， 借助海风和海浪向前涌去的上升气流，使身体向前冲射飞行。飞鱼跃出水面“飞行”的时间极短，只有几秒钟，然后又回到水中。

入水时，飞鱼的尾部先入水，如果这时还有敌人在追捕它，它又会用尾鳍拍打水面，重新跃起，逃避敌害。